Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM1Q92611 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms