Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGP1Q92546 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms