Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSPC1Q8WXF1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPC1Q8WXF1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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