Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS9Q8WXC6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms