Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE2Q8WWL2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIRE2Q8WWL2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms