Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms