Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPBAR1Q8TDU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms