Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms