Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF248Q8NDW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms