Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM35BQ8NCS4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms