Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP38Q8NB14 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP38Q8NB14 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP38Q8NB14 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP38Q8NB14 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP38Q8NB14 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP38Q8NB14 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP38Q8NB14 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP38Q8NB14 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP38Q8NB14 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms