Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC29Q8NA56 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms