Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMPERQ8N8U9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMPERQ8N8U9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BMPERQ8N8U9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms