Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYBPQ8N488 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYBPQ8N488 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 379.9 ms