Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
VPS8Q8N3P4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
VPS8Q8N3P4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms