Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00528Q8N1L1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms