Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D3Q8IZS8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D3Q8IZS8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D3Q8IZS8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms