Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf40Q8IXQ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf40Q8IXQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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