Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMKLAQ8IXN7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIMKLAQ8IXN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLAQ8IXN7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms