Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUNDC1Q8IVP5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FUNDC1Q8IVP5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUNDC1Q8IVP5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUNDC1Q8IVP5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUNDC1Q8IVP5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUNDC1Q8IVP5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUNDC1Q8IVP5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUNDC1Q8IVP5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms