Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX32Q86XE0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms