Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC84Q86UT8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms