Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMC4Q7Z404 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMC4Q7Z404 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMC4Q7Z404 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms