Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF550Q7Z398 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF550Q7Z398 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms