Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4Q7RTT9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4Q7RTT9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms