Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
HECW1Q76N89 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
HECW1Q76N89 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HECW1Q76N89 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms