Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRSAM1Q6UWE0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms