Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ATRAIDQ6UW56 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms