Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM220Q6QAJ8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM220Q6QAJ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms