Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM4Q6P4Q7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM4Q6P4Q7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms