Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K8

GTF2H2C, General transcription factor IIH subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2CQ6P1K8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2CQ6P1K8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms