Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RINT1Q6NUQ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RINT1Q6NUQ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms