Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD5Q6GMV2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMYD5Q6GMV2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD5Q6GMV2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377 ms