Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
CARMIL2Q6F5E8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CARMIL2Q6F5E8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL2Q6F5E8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms