Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP1Q6DN14 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms