Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
INTS3Q68E01 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms