Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
E4F1Q66K89 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4F1Q66K89 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms