Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD13Q5VXD3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms