Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms