Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXN1Q5VSR9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN1Q5VSR9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms