Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC18Q5T9S5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC18Q5T9S5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms