Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDLRAD1Q5T700 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms