Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
CEP170Q5SW79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CEP170Q5SW79 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms