Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPANXN3Q5MJ09 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms