Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPECC1Q5M775 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPECC1Q5M775 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms