Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPB2Q5JXA9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms