Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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