Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO1Q5FBB7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO1Q5FBB7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO1Q5FBB7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms