Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF542PQ5EBM4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF542PQ5EBM4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms