Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms