Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A4Q53GD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC44A4Q53GD3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.6 ms